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广州医科大学附属肿瘤医院肿瘤基因高通量测序采购项目调研公告

基本信息
项目名称 省份
业主单位 业主类型
总投资 建设年限
建设地点
审批机关 审批事项
审批代码 批准文号
审批时间 审批结果
建设内容
各(潜在)供应商(即报价人):
广州医科大学附属肿瘤医院现对肿瘤基因高通量测序(NGS)项目进行市场调研,欢迎符合资质条件的供应商参与。
一、采购项目名称:肿瘤基因高通量测序(NGS)项目
二、项目内容及要求:
1. 供应商应对所有的调研内容进行响应,不允许只对部分内容进行响应。
2. 项目概况:
序号
项目内容
检测技术
项目要求
期限
1
泛实体瘤检测项目
NGS
见附件1
1年
2
肺癌检测项目
NGS
见附件1
1年
3
神经系统肿瘤检测项目
NGS
见附件1
1年
4
淋巴造血系统肿瘤检测项目
NGS
见附件1
1年
5
消化系统肿瘤检测项目
NGS
见附件1
1年
6
其他系统肿瘤基因检测项目
NGS
见附件1
1年

3. 项目类别:服务类。
三、响应供应商资质要求:  
1. 报价人应具备《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定的条件。
2. 报价人具有可独立承担民事责任能力并在中华人民共和国境内(港澳台地区除外)注册的法人单位。
3. 具有完善的冷链运输和售后服务体系。
4. 本项目不接受联合体报价。
四、符合资格的供应商应当在2023年 8月 24 日至2023年 8月 31 日(工作日上午8:00-12:00和下午14:30-17:00时,法定节假日除外)到广州医科大学附属肿瘤医院医务科递交报价响应文件,报价响应文件必须包含以下内容:
1. 有效的法人执照(或证明)副本、组织机构代码证、税务登记证(国税、地税)复印件或三证合一证明文件复印件证明,分公司报价的,必须提供由具有法人资格的总公司授权原件;
2. 对采购内容要求的样本、技术及服务响应;
3. 提供本项目采购内容的报价清单。报价须列明报价构成,例如:检验费、材料费、设备使用费、必须的辅助材料费、系统对接费用、全额含税发票、雇员费用、合同实施过程中应预见或不可预见费等。所有相关清单须加盖投标人公章。
五、无效报价响应文件
如发生下列情况之一的,视为无效报价,其响应视为无效:
1. 报价文件逾期送达的;
2. 不符合报价文件规定资格要求;
3. 报价响应文件有应盖而未盖公章;
4. 报价文件中对技术、功能及服务要求响应不完全的;
5. 报价人的报价明显低于其他通过符合性审查报价人的报价,有可能影响产品质量或者不能诚信履约的,该报价人不能合理说明原因并提供证明材料的;
6. 报价响应文件关键内容字迹模糊、无法辨认的;
7. 报价响应文件含有采购人不能接受的附加条件的;
8. 提供虚假材料的;
9. 不符合法律、法规规定的其他实质性要求的。
六、本次项目调研公告等相关信息在广州医科大学附属肿瘤医院官方网站上公布,并视为有效送达,不再另行通知。本项目不举行集中答疑会,如有任何疑问请以书面形式提交采购人释疑。采购人对本采购事宜拥有最终解释权。
七、报价响应文件递交截止时间:2023年8月31日17时00分(注:9时00分开始受理响应文件)
八、本次调研仅用于了解市场情况,不产生成交供应商。
九、报价响应文件送达地点:广州医科大学附属肿瘤医院医务科。
十、采购人的名称、地址和联系方式:
采购人名称:广州医科大学附属肿瘤医院
采购人地址:广州市越秀区横枝岗路78号
联系人:登录即可免费查看
联系方式:(020)登录即可免费查看
    广州医科大学附属肿瘤医院
医务科
2023年8 月23日
 
附件
1. 项目内容及要求
2. 报价表
 
附件1  项目内容与要求
1.1 泛实体瘤基因检测项目
项目名称
技术参数要求
 
1、泛实体瘤基因检测(组织,基因数≤200)
1、靶向治疗相关基因: NTRK1/2/3,FGFR1/2/3/4,BRCA1, BRCA2, ATM, CDK12, CHEK2, PPP2R2A, BRIP1, BARD1, CHEK1, FANCL, PALB2, RAD51B, RAD51C, RAD51D 和RAD54L等  
2、化疗用药相关基因:包括不限于IDH2,XRCC1,TP53,ERCC2,MDM2,TYMS,BRCA,UGT1A1等                                                                                                                                                                                                               3、遗传风险基因:包括不限于ATM,BARD1 ,BRCA1,BRCA2, BRIP1,CDH1,CHEK1/2 ,MLH1 ,MRE11A, MSH2,MSH6,MUTYH, PALB2 PMS1,PMS2,PTENRAD50,RAD51,TP53等  
4、可检测CD274、POLE、POLD1、JAK1/2、EGFR、ALK、STK11等免疫疗效预测生物标志物
5、可检测突变类型有点突变(SNV)、插入缺失突变(Indel)、基因融合(Fusion)、拷贝数变异(CNV)。
6、平均测序深度:组织≥900X
2、泛实体瘤基因检测(血液,基因数≤200)
1、靶向治疗相关基因: NTRK1/2/3,FGFR1/2/3/4,BRCA1, BRCA2, ATM, CDK12, CHEK2, PPP2R2A, BRIP1, BARD1, CHEK1, FANCL, PALB2, RAD51B, RAD51C, RAD51D 和RAD54L等
2、化疗用药相关基因:包括不限于IDH2,XRCC1,TP53,ERCC2,MDM2,TYMS,BRCA,UGT1A1等                                                                                                                                                                                                               3、遗传风险基因:包括不限于ATM,BARD1 ,BRCA1,BRCA2, BRIP1,CDH1,CHEK1/2 ,MLH1 ,MRE11A, MSH2,MSH6,MUTYH, PALB2 PMS1,PMS2,PTENRAD50,RAD51,TP53等  
4、可检测CD274、POLE、POLD1、JAK1/2、EGFR、ALK、STK11等免疫疗效预测生物标志物
5、可检测突变类型有点突变(SNV)、插入缺失突变(Indel)、基因融合(Fusion)、拷贝数变异(CNV)。
6、平均测序深度:血液≥3000X
3、泛实体瘤基因检测(组织,200<基因数≤500)
1、检测覆盖靶向相关基因:AKT1/2/3、ALK、AR、BRAF、KRAS、ESR1、IGF1R、MTOR、NF1/2、PTCH1、PTEN、PTPN11、FGFR1/2/3/4、DDR2、MAP2K1/2、BRCA1/2、FLT3/4、ROS1、NTRK1/2/3、TSC1/2、HGF、HRAS、SMO等
2、检测覆盖免疫治疗相关基因:IFNGR1、JAK1/2、STK11、B2M、DNMT3A、MDM2/4、TP53、POLD1、POLE等                                                                                                                                                                                  3、遗传风险基因: ATM,BARD1 ,BRCA1,BRCA2, BRIP1,CDH1,CHEK1/2 ,MLH1 ,MRE11A, MSH2,MSH6,MUTYH, PALB2 PMS1,PMS2,PTENRAD50,RAD51,TP53等  
4、可检测突变类型有点突变(SNV)、插入缺失突变(Indel)、基因融合(Fusion)、拷贝数变异(CNV)、TMB、MSI
5、可检测包含肿瘤突变负荷(TMB)及MMR相关基因,提示免疫治疗疗效。
6、平均测序深度:组织≥450X
4、泛实体瘤基因检测(血液,200<基因数≤500)
1、检测覆盖靶向相关基因:AKT1/2/3、ALK、AR、BRAF、KRAS、ESR1、IGF1R、MTOR、NF1/2、PTCH1、PTEN、PTPN11、FGFR1/2/3/4、DDR2、MAP2K1/2、BRCA1/2、FLT3/4、ROS1、NTRK1/2/3、TSC1/2、HGF、HRAS、SMO等
2、检测覆盖免疫治疗相关基因:IFNGR1、JAK1/2、STK11、B2M、DNMT3A、MDM2/4、TP53、POLD1、POLE等                                                                                                                                                                                  3、遗传风险基因: ATM,BARD1 ,BRCA1,BRCA2, BRIP1,CDH1,CHEK1/2 ,MLH1 ,MRE11A, MSH2,MSH6,MUTYH, PALB2 PMS1,PMS2,PTENRAD50,RAD51,TP53等
4、可检测突变类型有点突变(SNV)、插入缺失突变(Indel)、基因融合(Fusion)、拷贝数变异(CNV)、TMB、MSI
5、可检测包含肿瘤突变负荷(TMB)及MMR相关基因,提示免疫治疗疗效。
6、平均测序深度:血液≥3000X
5、泛实体瘤基因检测(组织,基因数>500)
 
1、可检测肿瘤靶向治疗基因,包括且不限于:EGFR、KRAS、BRAF、ALK、ROS1、MET、RET、ERBB2、NRAS、KIT、PDGFRA、BRCA1/2等。
2、可检测DDR,HRR,MMR等DNA损失修复相关基因
3、可检测微卫星不稳定(MSI)状态
4、可检测CD274、POLE、POLD1、JAK1/2、EGFR、ALK、STK11等免疫疗效预测生物标志物
5、可检测突变类型有点突变(SNV)、插入缺失突变(Indel)、基因融合(Fusion)、拷贝数变异(CNV)、TMB
6、平均测序深度:组织≥900X                                                                                  
6、泛实体瘤基因检测(血液,基因数>500)
1、可检测肿瘤靶向治疗基因,包括且不限于:EGFR、KRAS、BRAF、ALK、ROS1、MET、RET、ERBB2、NRAS、KIT、PDGFRA、BRCA1/2等。
2、可检测DDR,HRR,MMR等DNA损失修复相关基因
3、可检测微卫星不稳定(MSI)状态
4、可检测CD274、POLE、POLD1、JAK1/2、EGFR、ALK、STK11等免疫疗效预测生物标志物
5、可检测突变类型有点突变(SNV)、插入缺失突变(Indel)、基因融合(Fusion)、拷贝数变异(CNV)、TMB
6、平均测序深度:血液≥3000X     

 
1.2 肺癌基因检测项目
项目名称
技术参数要求
 
1、肺癌基因检测(组织,基因数≤50)
1、可检测基因包含且不限于:ALK,BRAF,EGFR, KRAS,ROS1等。                                                                                                                                                                2、可检测MET、RET、NF1、NRAS、MEK1、PIK3CA、PTEN、AKT1等。                                                                                    3、可检测基因融合如ALK、RET、ROS1等基因和c-MET跳读变异等                                                      
4、可开放式检测ALK、ROS1基因融合,包括但不限于(EML4,KIF5B等)在内的所有融合伴侣基因及所有突变亚型。
5、可开放式检测HER2 基因20外显子插入突变,包括所有突变类型。
6、平均测序深度:组织≥500X
2、肺癌基因检测(血液,基因数≤50)
1、可检测基因包含且不限于:ALK,BRAF,EGFR, KRAS,ROS1等。                                                                                                                                                                2、可检测MET、RET、NF1、NRAS、MEK1、PIK3CA、PTEN、AKT1等。                                                                                    3、可检测基因融合如ALK、RET、ROS1等基因和c-MET跳读变异等                                                      
4、可开放式检测ALK、ROS1基因融合,包括但不限于(EML4,KIF5B等)在内的所有融合伴侣基因及所有突变亚型。
5、可开放式检测HER2 基因20外显子插入突变,包括所有突变类型。
6、平均测序深度:血液≥4000X
3、肺癌基因检测(组织,50<基因数≤200)
1、检测肺癌靶向药物相关基因,包括且不限于AKT1、ALK、ARAF、ATM、BRAF、BRCA1、BRIP1、CDK4、CDKN2A、CHEK2、EGFR、HER2、FGFR1/3、HRAS、IDH1/2、KIT、KRAS、MAP2K1(MEK1)、MET、PIK3CA、PTEN、RET、ROS1、SMARCB1、TP53、TSC1/2等
2、检测化疗药物相关基因,包括且不限于CDA、CYP2B6、CYP2C19、DPYD、ERCC1/2、GSTM1、GSTP1、GSTT1、IDH1/2、MTHFR、NQO1、TP53、TPMT、TYMS等
3、可检测用于明确肺癌患者的分子分型。
4、平均测序深度:组织≥1000x
4、肺癌基因检测(血液,50<基因数≤200)
1、检测肺癌靶向药物相关基因:AKT1、ALK、ARAF、ATM、BRAF、BRCA1、BRIP1、CDK4、CDKN2A、CHEK2、EGFR、HER2、FGFR1/3、HRAS、IDH1/2、KIT、KRAS、MAP2K1(MEK1)、MET、MTOR、NF1、NRAS、NTRK1/3、PDGFRA、PIK3CA、PTEN、RET、ROS1、SMARCB1、TP53、TSC1/2等
2、检测化疗药物相关基因:CDA、CYP2B6、CYP2C19、DPYD、ERCC1/2、GSTM1、GSTP1、GSTT1、IDH1/2、MTHFR、NQO1、TP53、TPMT、TYMS、UGT1A1、XRCC1等
3、可检测用于明确肺癌患者的分子分型。
4、平均测序深度:血液≥5000x;

 
1.3神经系统肿瘤基因检测项目
项目名称
技术参数要求
1、脑胶质瘤基因检测(组织,基因数≥6)
1、用于分子分型的基因,包括且不限于:IDH1、IDH2、TERT、BRAF、TP53、CDKN2A、CDKN2B、EGFR、1p19q等
2、用于用药指导的基因需包括:MGMT甲基化
3、用于预后评估的基因需包括且不限于:IDH1、IDH2、TERT、1p19q等
4、可检测包含IDH1/IDH2点突变、1p19q联合缺失、TERT点突变 、MGMT启动子甲基化、BRAF点突变、HIST1H3B/H3F3A点突变
5、平均测序深度:组织≥1000x
2、脑胶质瘤基因检测(血液,基因数≥6)
1、用于分子分型的基因,包括且不限于:IDH1、IDH2、TERT、BRAF、TP53、CDKN2A、CDKN2B、EGFR、1p19q等
2、用于用药指导的基因需包括:MGMT甲基化
3、用于预后评估的基因需包括且不限于:IDH1、IDH2、1p19q、TERT等
4、可检测包含IDH1/IDH2点突变、1p19q联合缺失、TERT点突变 、MGMT启动子甲基化、BRAF点突变、HIST1H3B/H3F3A点突变
5、平均测序深度:血液≥1000x
3、中枢神经系统肿瘤基因检测(组织,基因数≥100)
1、可检测分型及预后相关基因:1p19q、CDKN2B、MYB、H3F3A、APC、EGFR、MYC、TERT、ATRX、FGFR1、BAP1、FGFR2、HRAS、NF1、FGFR3、IDH1、NF2 、BRAF、FGFR4、IDH2、NOTCH1、RELA、CDKN2A、KRAS、NRAS等;
2、可检测药物治疗相关基因:IDH1、PDGFR、VEGFR、EGFR、SMO、AKT1、SSTR2、AKT1、PI3K、PDGFRB、JAK1、JAK2、MYC、ABCB1、TP53、BRCA1、BRCA2、GSTT1、GSTP1、MDM2、IDH1、MGMT、IDH2等。
3、可检测TMB、MSI
4、可检测遗传风险基因:NF1、ALK、APC、ATM、ATR、AXIN2、BAP1、BARD1、BLM、BMPR1A、BRAF、BRCA1、BRCA2等
5、平均测序深度:组织≥1000x
4、中枢神经系统肿瘤基因检测(血液,基因数≥100)
1、可检测分型及预后相关基因:1p19q、CDKN2B、MYB、H3F3A、APC、EGFR、MYC、TERT、ATRX、FGFR1、BAP1、FGFR2、HRAS、NF1、FGFR3、IDH1、NF2 、BRAF、FGFR4、IDH2、NOTCH1、RELA、CDKN2A、KRAS、NRAS等;
2、可检测药物治疗相关基因:IDH1、PDGFR、VEGFR、EGFR、SMO、AKT1、SSTR2、AKT1、PI3K、PDGFRB、JAK1、JAK2、MYC、ABCB1、TP53、BRCA1、BRCA2、GSTT1、GSTP1、MDM2、IDH1、MGMT、IDH2等。
3、可检测遗传风险基因:NF1、ALK、APC、ATM、ATR、AXIN2、BAP1、BARD1、BLM、BMPR1A、BRAF、BRCA1、BRCA2等
4、可检测TMB、MSI
5、平均测序深度:血液≥1000x
5、脑肿瘤基因检测(组织,基因数≥100)
 
1、可检测分子分型的基因:IDH1、IDH2、ATRX、TP53、EGFR、RELA、YAP1、MYB、NF2、AKT1、SMO、TRAF7、KLF4、PIK3CA、POLR2A、CDKN2A、CDKN2B、SMARCE1、TERT、BRAF、H3F3A、1p19q
2、可检测遗传风险相关基因:NF1、NF2、PTEN、DMD、TP53、PTCH1、SUFU、VHL、SMARCB1、SMARCE1、ALK、APC等
4、可检测用药指导的基因:IDH1、PDGFR、VEGFR、EGFR、SMO、AKT1、SSTR2、AKT1、PI3K、PDGFRB、JAK1、JAK2、MYC、ABCB1、TP53、MTHFR、GSTP1、SOD2、XRCC1、CYP2C19、MET、CDK6、KRAS、H3F3A、BRAF等
5、用于免疫治疗的基因需包括:MSI、MMR、TMB
6、平均测序深度:组织≥1000x
6、脑肿瘤基因检测(血液,基因数≥100)
1、可检测分子分型的基因:IDH1、IDH2、ATRX、TP53、EGFR、RELA、YAP1、MYB、NF2、AKT1、SMO、TRAF7、KLF4、PIK3CA、POLR2A、CDKN2A、CDKN2B、SMARCE1、TERT、BRAF、H3F3A、1p19q等 
2、可检测遗传风险相关基因:NF1、NF2、PTEN、DMD、TP53、PTCH1、SUFU、VHL、SMARCB1、SMARCE1、ALK、APC等
4、可检测用药指导的基因:IDH1、PDGFR、VEGFR、EGFR、SMO、AKT1、SSTR2、AKT1、PI3K、PDGFRB、MYC、ABCB1、TP53、MTHFR、GSTP1、XRCC1、CYP2C19、MET、CDK6、KRAS、H3F3A、BRAF等
5、用于免疫治疗的基因需包括:MSI、MMR、TMB
6、平均测序深度:血液≥1000x

 
1.4 淋巴造血系统肿瘤基因检测项目
项目名称
技术参数要求
1、血液肿瘤多基因检测(组织、血液,基因数≥100)
1、可检测染色体结构异常
2、可检测单碱基突变,小片段插入/缺失,拷贝数变异和重要基因重排,重排相关重要内含子区域重点覆盖,包括MYC、BCL2、BCL6、CCND1等。
3、平均测序深度:组织≥1000X,血液≥5000X
2、髓系肿瘤多基因检测(组织、血液,基因数≥80)
1、可检测诊断相关基因:ABL1、EZH2、NRAS、SRSF2、ASXL1、FGFR1、STAG2、BCR、IDH1/2、TET2、CALR、JAK2/3、PDGFRB、TP53、CBFB、KIT、MYH11、RUNX1、CEBPA、MPL、RARA、DNMT3A、NF1、SETBP1、ETV6等
2、可检测治疗相关基因:ABL1、PDGFRA、BCL2、PDGFRB、BCR、PML、CSF3R、RARA、FGFR1、SMO、FLT3、SRC、JAK1/2、TET2、IDH1/2、STAT3、KIT、TP53、NPM1、XPO1等
4、可检测点突变、插入缺失突变、拷贝数变化等多种类型突变。
5、平均测序深度:组织≥1000X,血液≥5000X
3、多发性骨髓瘤基因检测(组织、血液,基因数≥70)
1、可检测诊断相关基因:APC、FGFR3、NF1、ARID1A、NRAS、BRAF、KDM5C、PIK3CA、BRCA2、KDR、PTPRD、CCND1、KRAS、RB1、CCND3、MAF、SETD2、CHD8、MAFB、SPEN、A、TP53、FANCA、TRAF3、FAT1/4 等
2、可检测治疗相关基因:BRAF、CDK4/6、CREBBP、EP300、FGFR3、IDH1/2、KRAS、NFKB1/2、NFKBIA、NRAS
3、平均测序深度:组织≥1000X,血液≥5000X
4、B细胞淋巴瘤多基因检测(组织、血液,基因数≥100)
1、可检测单碱基突变,小片段插入/确实,基因扩增和重要基因融合等
2、可检测诊断关键基因:B2M、CREBBP、MEF2B、BCL2、CXCR4、MYC、BCL6、EP300、MYD88、BRAF、EZH2、NOTCH2、CARD11、GNA13、PAX5、CCND1、ID3、SPEN、CD79A、KMT2C、TNFAIP3、CCND2、IRF4、TCF3、CD79B、KMT2D、TP53等
3、可检测治疗基因:BCL2、MAP2K1、BCL6、MTOR、BIRC3、MYD88、BTK、CXCR4、PLCG2、SYK、STAT3、LYN、TP53、MALT1等。
4、平均测序深度:组织≥1000X,血液≥5000X
5、T细胞淋巴瘤多基因检测(组织、血液,基因数≥100)
1、可检测诊断相关基因:ALK、KDM6A、STAT5B、APC、KIT、STAT6、BCOR、MAP2K1、TET2、CD28、NPM1、TP63、DDX3X、PDGFRA、FLT3、PDGFRB、IDH1、IDH2、SETD2、IL7R、STAT3、IDH2等
2、可检测指导治疗基因:ALK、IDH1、ARID2、IDH2、B2M、KMT2C、BRAF、MTOR、、NRAS、EP300、PIK3CA、STAT3、EZH2、SMO、TP53等。
3、平均测序深度:组织≥1000X,血液≥5000X

 
1.5 消化系统肿瘤基因检测项目
项目名称
技术参数要求
1、肠癌基因检测(组织、血液,基因数≥20)
1、可检测靶向药物基因: KRAS,AKT1,MET,APC,NRAS,ALK,MLH1,SMAD4,BRAF,CDKN2A,PIK3CA,ERBB2,EGFR,PTEN,STK11,NTRK1,FBXW7,TP53,DDR2,NTRK3等
2、可检测RAS基因(包括KRAS、NRAS、HRAS)及BRAF基因外显子,预测EGFR单抗类药物(如西妥昔单抗)疗效,提示疗效信息
3、平均测序深度:组织≥500X ,血液≥1000X
2、胃癌基因检测(组织、血液,基因数≥20)
1、可检测基因BRAF,ERBB2,NTRK1,NTRK3
3、可检测胃癌潜在药物靶点基因:ATM,FGFR3,NRAS,CTNNB1,KRAS,PIK3CA,EGFR,MAP2K1,PTEN,ERBB4,MET,TP53,FGFR2,NF1等
4、可检测MMR相关基因,如:MLH1、MSH2、MSH6、PMS2,提示免疫治疗疗效;
5、可检测HER2基因变异信息(基因扩增/突变),预测患者是否能从抗HER2治疗中获益
6、平均测序深度:组织≥500X ,血液≥1000X
3、肝胆肿瘤基因检测(组织、血液,基因数≥30)
1、可检测肝癌用药相关基因:AKT1, FGFR2,KIT,MET,NTRK3,RET,ALK,CTNNB1,FGFR3, MLH1,SMAD4,ATM,EGFR,FGFR4,KRAS,NF1,PIK3CA,STK11,BRAF,ERBB2, MAP2K1,NRAS,PTEN,TP53,FGFR1,KDR,MAPK1,NTRK1,RB1等
2、可检测血管生成相关基因所有变异信息(FGFR、VEGFA基因扩增、突变等)
3、平均测序深度:组织≥500X ,血液≥1000X
4、胃肠间质瘤基因检测(组织、血液,基因数≥20)
1、基因数≥20个
2、检测NCCN/CSCO指南/国内共识推荐基因:KIT,BRAF,PDGFRA,NF1,NTRK1,FGFR1,NTRK3,FGFR2,KRAS,FGFR3,PIK3CA
3、可检测基因APC,PTEN,CDKN2A,RB1,CTNNB1,TP53,HRAS,NRAS,MET等
4、平均测序深度:组织≥500X ,血液≥1000X

1.6 其他系统肿瘤基因检测项目
项目名称
技术参数要求
1、甲状腺癌基因检测(组织、血液,基因数≥16)
1、可检测微卫星区域和MMR相关基因,如:MLH1、MSH2、MSH6、PMS2,提示免疫治疗疗效
2、可检测ALK、NTRK1/2/3、AKT1、BRAF、CD274、EGFR、PIK3CA、HRAS、PTEN、KRAS、ROS1、KIT、RET、MET、NRAS等基因突变信息,指导靶向用药
3、可检测BRCA1、TP53、TUBB3、XRCC1、GSTM1、GSTP1、GSTT1、IDH11、MDM2、STMN1、TOP2A等基因突变,预测化疗药物毒副作用
4、平均测序深度:组织≥1000X,血液≥5000X
2、乳腺癌基因检测(组织、血液,基因数≥20
1、可检测微卫星区域和MMR相关基因,如:MLH1、MSH2、MSH6、PMS2,提示免疫治疗疗效
2、可检测HER2基因变异信息(基因扩增/突变),预测患者是否能从抗HER2靶向治疗中获益
3、可检测PI3K-mTOR信号通路相关基因,预测患者是否能从依维莫司治疗中获益
4、可检测BRCA1/2突变,预测患者是否能从PARP抑制剂中获益
5、可检测ER(雌激素受体)的突变信息,预测患者是否能从内分泌治疗中获益
6、可检测乳腺癌常见信号通路PI3K-mTOR与MAPK,明确原发与继发耐药机制,提供进一步靶向治疗方案
7、平均测序深度:组织≥1000X,血液≥5000X
3、妇科肿瘤基因检测(组织、血液,基因数≥70)
1、可检测微卫星区域和MMR相关基因,如:MLH1、MSH2、MSH6、PMS2,提示免疫治疗疗效
2、可检测BRCA1/2基因以及HRR通路ATM、PALB2等基因,预测患者是否能从PARP抑制剂中获益
3、可检测子宫内膜癌分子分型分子POLE突变、微卫星不稳定MSI状态和TP53突变,指导子宫内膜癌分型和预后
4、可检测BRCA1/2、MTHFR、NQO1、CDA、TOP1、CYP2B6、TOP2A、DPYD、TP53、ERCC1、ERCC2、TYMS、GSTP1、XRCC1、GSTM1、UGT1A1、GSTT1、MDM2等基因
5、平均测序深度:组织≥1000X,血液≥5000X
4、黑色素瘤基因检测(组织、血液,基因数≥50)
1、可检测微卫星区域和MMR相关基因,如:MLH1、MSH2、MSH6、PMS2,提示免疫治疗疗效
2、可检测ALK、NF2、RET、AKT1、NOTCH1、ROS1、AKT2、NRAS、BRAF、NTRK1/2/3、PD-L1、HRAS、PTEN、KIT、KRAS、PD-3、MEK1、NF1等基因突变信息,指导靶向用药
4、可检测BRCA1/2、STMN1、TP53、ERCC1/2、TUBB3、XRCC1、GSTM1、GSTP1、GSTT1、IDH1/2、MGMT、RET等基因突变,预测化疗药物毒副作用
5、平均测序深度:组织≥1000X,血液≥5000X
5、肉瘤基因检测(组织、血液,基因数≥500)
1、检测肉瘤相关基因全外显子和融合相关重要内含子、骨肉瘤相关融合基因、融合伴侣及突变信息,辅助骨肉瘤诊断和分子分型
2、可检测分子分型及预后相关基因:ALK、CDKN2A、GLI1、IDH1、NCOA2、NTRK2、PAX7、RB1、SMARCB1、TFE3、YWHAE、APC、CDKN2B、EED、FEV、GNAS、IDH2、NF1、NTRK3、PDGFB、ROS1、SRF、TP53、ZC3H7B、ATF1、CIC、ERG、FGFR1、H3F3A、KIT、NF2、NUTM1、PDGFRA、SDHA、SS18、TSC2、ATIC、CITED2、ETV1、FGFR4、H3F3B、KRAS、NFATC2等
3、可检测TMB、MSI/MMR 及其他免疫疗效相关基因,如:MLH1、MSH2、MSH6、PMS2等,指导免疫治疗
4、平均测序深度:组织≥1000X,血液≥5000X。
6、前列腺癌基因检测(组织、血液,基因数≥65)
1、可检测微卫星区域和MMR相关基因,如:MLH1、MSH2、MSH6、PMS2,提示免疫治疗疗效;
2、可检测AR(雄激素受体基因)的突变信息,明确原发与继发耐药,及时更换治疗方案;
3、可检测BRCA1/2所有外显子及重要内含子区域、单核苷酸变异、小片段插入缺失、大片段重排,预测PARP抑制剂疗效
4、可检测其他靶向相关基因:AKT1、PPP2R2A、ATM、PTEN、BARD1、FGFR1、RAD51B、BRAF、FGFR2、RAD51C、KRAS、RAD51D、NRAS、RAD54L、BRIP1、NTRK1/2/3、RET、CHEK1、TP53、CDK12、ROS1、CHEK2、PALB2、EGFR、PIK3CA等
5、可检测ERCC1/2、GSTP1、UGT1A1、XRCC1、TP53、GSTM1、GSTT1等化疗药物代谢及毒副作用相关基因,预测化疗疗效
7、平均测序深度:组织≥1000X,血液≥5000X

 
附件2. 报价表
内容名称
序号
项目名称
包含基因数
(个)
项目报价
(单例/元)
 
泛实体瘤基因检测项目
1
泛实体瘤基因检测(组织,基因数≤200)
 
 
2
泛实体瘤基因检测(血液,基因数≤200)
 
 
3
泛实体瘤基因检测(组织,200<基因数≤500)
 
 
4
泛实体瘤基因检测(血液,200<基因数≤500)
 
 
5
泛实体瘤基因检测(组织,基因数>500)
 
 
6
泛实体瘤基因检测(血液,基因数>500)
 
 
肺癌基因检测项目
1
肺癌基因检测(组织,基因数≤50)
 
 
2
肺癌基因检测(血液,基因数≤50)
 
 
3
肺癌基因检测(组织,50<基因数≤200)
 
 
4
肺癌基因检测(血液,50<基因数≤200)
 
 
神经系统肿瘤基因检测项目
1
脑胶质瘤基因检测(组织,基因数≥6)
 
 
2
脑胶质瘤基因检测(血液,基因数≥6)
 
 
3
中枢神经系统肿瘤基因检测(组织,基因数≥100)
 
 
4
中枢神经系统肿瘤基因检测(血液,基因数≥100)
 
 
5
脑肿瘤基因检测(组织,基因数≥100)
 
 
6
脑肿瘤基因检测(血液,基因数≥100)
 
 
淋巴造血系统肿瘤基因检测项目
1
血液肿瘤多基因检测(组织、血液,基因数≥100)
 
 
2
髓系肿瘤多基因检测(组织、血液,基因数≥80)
 
 
3
多发性骨髓瘤基因检测(组织、血液,基因数≥70)
 
 
4
B细胞淋巴瘤多基因检测(组织、血液,基因数≥100)
 
 
5
T细胞淋巴瘤多基因检测(组织、血液,基因数≥100)
 
 
消化系统肿瘤基因检测项目
1
肠癌基因检测(组织、血液,基因数≥20)
 
 
2
胃癌基因检测(组织、血液,基因数≥20)
 
 
3
肝胆肿瘤基因检测(组织、血液,基因数≥30)
 
 
4
胃肠间质瘤基因检测(组织、血液,基因数≥20)
 
 
其他系统肿瘤基因检测项目
1
甲状腺癌基因检测(组织、血液,基因数≥16)
 
 
2
乳腺癌基因检测(组织、血液,基因数≥20)
 
 
3
妇科肿瘤基因检测(组织、血液,基因数≥70)
 
 
4
黑色素瘤基因检测(组织、血液,基因数≥50)
 
 
5
肉瘤基因检测(组织、血液,基因数≥500)
 
 
6
前列腺癌基因将按此(组织、血液,基因数≥65)
 
 

 
 
                                                     报价单位:(盖章)
                                                              报价时间:2023年   月    日
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