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中国科学院上海药物研究所细菌单细胞转录组测序分析采购项目中标公告

基本信息
项目名称 省份
业主单位 业主类型
总投资 建设年限
建设地点
审批机关 审批事项
审批代码 批准文号
审批时间 审批结果
建设内容
一、项目编号:OITC-G230302466(招标文件编号:OITC-G230302466)
二、项目名称:中国科学院上海药物研究所细菌单细胞转录组测序分析采购项目
三、中标(成交)信息
供应商名称:杭州跃真生物科技有限公司
供应商地址:浙江省杭州市余杭区仓前街道余杭塘路2626号2幢201室
中标(成交)金额:399.0000000(万元)
四、主要标的信息
序号    供应商名称      服务名称      服务范围      服务要求      服务时间      服务标准  
1    杭州跃真生物科技有限公司      细菌单细胞转录组测序分析      对细菌样本进行微生物组细菌单细胞转录组测序及分析,可检测细菌样本类型为冻存或福尔马林固定样本。      1.1.*每次可检测样本量不低于4个。
1.2.*投标方内部有规范的质控和 SOP 要求。
1.3.微生物组样本进行细菌单细胞悬液制备,每个样本获得满足实验要求的细菌数量不少于10,000,000个,且制备的悬液中细菌结团率 < 10%,无明显杂质。
1.4.从悬液制备到文库构建完成不超过48小时。
1.5.文库浓度不低于2ng/μl(不少于20μl)。
1.6.文库片段大小符合二代测序要求,即主要片段分布于300bp-700pb。
1.7.文库制备成功率大于70%(计算方法:文库制备成功数/细菌单细胞悬液镜检合格数 X 100%)。
1.8.细菌单细胞进行barcode标记时间小于15分钟,上机成功率>75%。
1.9.cDNA的总体片段大小在100 bp-1000 bp之间,不低于100 bp,且100-200 bp 片段占比低于20%。
1.10.测序质控要求:Q30>85%、有效barcode比例>80%、基因组比对率>70%。
1.11.捕获细菌数1000-20000,中位基因数(以150G,5000个细菌为例)>70个/细胞。
1.12.#可利用微生物组细菌单细胞转录组数据进行物种注释,完成物种鉴定(至“种”水平)。
1.13.#可完成微生物组细菌单细胞转录组基因表达矩阵分析以及UMAP分析。
1.14.#可利用微生物组细菌单细胞转录组数据进行至少3种以上优势菌群的信号通路分析。
1.15.#可利用微生物组细菌单细胞转录组数据进行对应的噬菌体分析。  
   合同签订之日起,30个工作日内      合同签订之日起,每批次送样少于16个样本,在30个工作日内完成测试及后续分析  
             

五、评审专家(单一来源采购人员)名单:
蔡玉川 杨莉萍 闫红霞 李哲峰 刘红椿(用户代表)
六、代理服务收费标准及金额:
本项目代理费收费标准:1980号文
本项目代理费总金额:0.000000 万元(人民币)
七、公告期限
自本公告发布之日起1个工作日。
八、其它补充事宜
附件:招标文件
九、凡对本次公告内容提出询问,请按以下方式联系。
1.采购人信息
名 称:中国科学院上海药物研究所     
地址:上海市浦东张江祖冲之路555号        
联系方式:登录即可免费查看,登录即可免费查看      
2.采购代理机构信息
名 称:东方国际招标有限责任公司            
地 址:北京市海淀区丹棱街1号互联网金融中心20层            
联系方式:登录即可免费查看,登录即可免费查看            
3.项目联系方式
项目联系人:登录即可免费查看
电 话:  登录即可免费查看
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