2024-fw-003--免规测序服务采购公告
微信分享
关注项目
标讯收藏
| 项目名称 | 省份 | ||
| 业主单位 |
认领
立即查看
|
业主类型 | |
| 总投资 | 建设年限 | ||
| 建设地点 | |||
| 审批机关 | 审批事项 | ||
| 审批代码 | 批准文号 | ||
| 审批时间 | 审批结果 | ||
| 建设内容 | |||
一、采购项目名称及内容
采购人：广西壮族自治区疾病预防控制中心；
采购项目名称：免疫规划检测项目测序服务；
项目编号：2024-FW-003；
资金来源：财政资金。
二、项目内容
（一）菌株全基因组测序：30次。
1．样本类型和数量：纯化后的细菌6株
2．DNA提取：采用SDS或STE的方法对样本的基因组DNA 进行提取，之后利用琼脂糖凝胶电泳检测DNA 的纯度和完整性，利用Qubit进行定量。
3．文库构建： 经电泳检测合格的 DNA 样品用 Covaris 超声波破碎仪随机打断成长度约为350bp的片段。处理完成后的DNA片段，使用 NEBNext®Ultra™ DNA Library Prep Kitfor Illumina(NEB, USA)试剂盒，经末端修复、加A尾、加测序接头、纯化、PCR扩增等步骤完成整个文库制备。
4．文库检测：文库构建完成后，先使用 Qubit 2.0 进行初步定量，稀释文库至 2ng/ul，使用 Agilent对文库的插入片段进行检测，insert size符合预期后，使用 Q-PCR 方法对文库的有效浓度进行准确定量，以保证文库质量。
5．测序和交付平台：使用illumina NovaSeqPE150上机测序，运行智能化交付系统和自动化样本库系统；
6．数据质量：原始下机数据测序质量要求: Q20≥90%，Q30≥85%；
7．数据量：raw data≥1G/样本；
8．数据交付：需要交付clean data；
9．周期要求：需要保证项目可加急得到响应，二代测序仪充足≥15台；
10．生物信息学分析内容：
① 原始下机数据处理:过滤测序质量值低的reads，保留高质量reads，得到Clean Data；
② 样品组装: 进行基因组组装，得到能反映样品基因组基本情况的序列文件，并对组装结果进行评价；
③ 基因组组分分析 组装完成后，分析样品基因组的成分，包括编码基因、非编码RNA、重复序列、前噬菌体、基因岛、CRISPR等基因组成分的预测；
④ 功能注释 针对编码基因序列进行不同数据库的功能注释，包括常用的KEGG、COG数据库、针对病原微生物的数据库；
⑤ 基因组比较分析 此步骤从基因组、基因两层面分别比较样品与参考基因组的差异，包括共线性分析、基因家族构建、共有/特有基因分析、物种进化树构建。
（二）一代测定服务：400反应。
1．样本为PCR产物和引物，PCR产物未纯化，引物浓度为20μM。
2．★一代测定服务包括：序列测定在技术服务公司实验室完成，对PCR产物纯化，并按照送样者要求的长度进行基因序列测定。将测序结果以图谱形式反馈。
3．★ PCR产物纯化方式：胶回收纯化。
4．测序要求：双向或者单向，送检单会标明。
5．测序序列质量：一个正常的成功反应，能保证测序色谱图文件（*.abi） 峰形清晰，无杂峰，峰值明显。
6．★提供的结果为：测序色谱图文件（*.abi）、终序列、拼接序列（*.fas或*.fasta）。结果反馈地点及数量：按照采购方要求发往指定服务地点。
7．检测中使用的试剂和耗材均需为优质无菌。
8．开展服务的实验室符合二级生物安全实验室要求，具备生物安全柜。
9．凡该样本在检测过程中发生的污染和各类纠纷，后果由服务商承担。
10．★服务商负责样品运输，样本运输必须在带冰条件下运输。运输过程中造成的损失、污染、及各类纠纷，后果均由服务商承担。运输费用由服务商承担。
11．样本交接：根据采购方的要求，在广西壮族自治区疾病预防控制中心不定期进行标本交接。
12．服务商及技术服务公司未经采购方同意，不能将剩余样本另作他用或转让给第三方使用，根据采购方要求进行保存返回或按照相关规定处理。
（三）提供的成果
包含但不限于：出具检测原始数据、汇总结果（Excel文件列出标本名称以及对应的各指标结果）、样本接收单。
（四）提交服务成果时间
收到样本并质检合格后，一代测定服务于3～8个工作日内完成检测并返回结果；菌株全基因组测序于30个工作日内完成所有项目分析内容。售后服务包括能提供现场报告解读。若样本未检出或峰图有杂峰等无法分析，重测也如此，视为此次测序无效，采购方将不支付相应费用。如连续三次未及时反馈结果，采购方有权拒绝支付相应费用，并追究样本损失。
（五）其他要求：
1．开展服务的实验室符合二级生物安全实验室要求，具备生物安全柜。
2．凡该样本在检测过程中发生的污染和各类纠纷，后果由服务商承担。
3．★ 服务商负责样品运输，样本运输必须在带冰条件下运输。运输过程中造成的损失、污染、及各类纠纷，后果均由服务商承担。运输费用由服务商承担。
4．样本交接：根据采购方的要求，在广西壮族自治区疾病预防控制中心不定期进行标本交接。
5．服务商及技术服务公司未经采购方同意，不能将剩余样本另作他用或转让给第三方使用，根据采购方要求进行保存返回或按照相关规定处理。
① PCR产物测序使用的试剂应具备中华人民共和国医疗器械注册证（体外诊断试剂）或者为成熟的商业化试剂盒，使用的测序仪应具备中华人民共和国医疗器械注册证或者为成熟的商业化测序平台。
② 实验过程必须严格按照试剂说明书进行操作；在PCR产物质量过关的前提下，中标供应商须对每批样本测序实验进行质控，不可出现实验交叉污染、样本弄混等严重错误；出现此类错误导致的一切成本损耗皆由其负责。
③ 参与投标的供应商须具备纯化PCR产物的能力，并保证PCR产物符合测序要求；接收到待检样本后至建库测序数据产出，应有严格的质控标准；具有短期处理大量样本，进行一代测序的经验；不得将测序服务转包第三方公司。
④ 样本收取及运输管理：按照《可感染人类的高致病性病原微生物菌（毒）种或样本运输管理规定》的运输管理规范进行标本运输，根据采购人指定的时间、地点，由中标供应商上门收样后将样本运回实验室。
⑤ 采购人对检测调查结果拥有所有权，供应商对检测调查结果负有保密义务，仅提供给采购人或采购人指定的人员；未经采购人许可，不得对第三方泄露检测信息，不得在报刊杂志上发表或作其他任何用途的引用。
⑥ 中标供应商应在样本接收后及时对PCR产物进行质检，将结果反馈给采购人；所有未使用完的样本应免费保存至少1个月，并在必要时返回原样。剩余样本未经采购人同意不能将另作他用、转让给第三方使用或应按照相关规定高压后处理。
（六）服务地点：检测服务在中标供应商的实验室内完成。
（七）采购预算：3.14万元，其中菌株全基因组测序为700元/株、一代测定为26元/反应。
（八）报价要求：包括：服务的价格；必要的保险费用和各项税金；运输、装卸、安装、调试、培训、技术支持、售后服务、税金及其它所有成本费用的总和。
采购项目的名称、数量、简要规格描述详见附件报价表，须用使用统一格式报价表，否则投标无效。
（九）付款条件：按中标实际单价、实际检测并验收合格的份数进行结算。
（十）采购结果认定：满足采购需求的前提下最低价中标，超出预算的投标视为无效。
二、资格要求及条件
1.投标人须是国内注册企事业单位，拥有独立法人资格，具有有效的营业执照、税务登记证、组织机构代码、技术服务许可证、医疗机构执业许可证》、生物安全II级实验室备案证明。
2.检测实验室必须已开展测序服务实验（提供复印件，原件备查）并承诺独立完成本项目，不得转让或转包或分包。
3.投标人须符合《政府采购法》第二十二条规定的条件；
4.投标人在“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）或中国政府采购网（www.ccgp.gov.cn）查询相关供应商主体信用记录，将查询结果加盖投标人单位公章提交（必须提供，如为事业单位及高校可不提供）；
5.服务工作周期：签订合同之日起到2025年5月31日。如连续三次未及时反馈结果，采购方有权拒绝支付相应费用。
6.具有履行合同所必需的人员和专业服务能力；
7.国家法律、法规规定的其他要求；
8.验收方式：
供应商提供的成果包含提供的成果包含出具检测原始数据、汇总结果（Excel文件列出标本名称以及对应的各指标结果）、样本接收单等进行验收。
9.付款方式
按实际检测份数及项目报价单价结算，采购人收到并对结果无异议，凭验收单中的检测实际数量，根据供应商开具相应发票，在10个工作日内支付全部的费用。采购人对发票有异议的，应在收到发票后3日内向供应商提出异议，双方协商解决。
10.其他：应统一按附件报价表进行报价，不能恶意低价投标。
11.投标人根据报价表填写拟采购项目相关信息及价格一同密封提交（资格要求及条件材料装订成册）。闭封袋密封处需加盖递交单位公章，密封文件袋封面须注明产品名称，递交公司全称（信封密封口盖骑缝章）。
三、投送材料截止时间、地点
1.截止日期：2024年5月31日下午16点；
2.截止地点：南宁市青秀区金洲路18号广西疾病预防控制中心行政楼2楼206号房。采购管理科联系人及电话：蒙婧婷、李杰文0771-2521500。
fw-003统一报价表.xlsx
广西壮族自治区疾病预防控制中心
2024年5月23日
采购人：广西壮族自治区疾病预防控制中心；
采购项目名称：免疫规划检测项目测序服务；
项目编号：2024-FW-003；
资金来源：财政资金。
二、项目内容
（一）菌株全基因组测序：30次。
1．样本类型和数量：纯化后的细菌6株
2．DNA提取：采用SDS或STE的方法对样本的基因组DNA 进行提取，之后利用琼脂糖凝胶电泳检测DNA 的纯度和完整性，利用Qubit进行定量。
3．文库构建： 经电泳检测合格的 DNA 样品用 Covaris 超声波破碎仪随机打断成长度约为350bp的片段。处理完成后的DNA片段，使用 NEBNext®Ultra™ DNA Library Prep Kitfor Illumina(NEB, USA)试剂盒，经末端修复、加A尾、加测序接头、纯化、PCR扩增等步骤完成整个文库制备。
4．文库检测：文库构建完成后，先使用 Qubit 2.0 进行初步定量，稀释文库至 2ng/ul，使用 Agilent对文库的插入片段进行检测，insert size符合预期后，使用 Q-PCR 方法对文库的有效浓度进行准确定量，以保证文库质量。
5．测序和交付平台：使用illumina NovaSeqPE150上机测序，运行智能化交付系统和自动化样本库系统；
6．数据质量：原始下机数据测序质量要求: Q20≥90%，Q30≥85%；
7．数据量：raw data≥1G/样本；
8．数据交付：需要交付clean data；
9．周期要求：需要保证项目可加急得到响应，二代测序仪充足≥15台；
10．生物信息学分析内容：
① 原始下机数据处理:过滤测序质量值低的reads，保留高质量reads，得到Clean Data；
② 样品组装: 进行基因组组装，得到能反映样品基因组基本情况的序列文件，并对组装结果进行评价；
③ 基因组组分分析 组装完成后，分析样品基因组的成分，包括编码基因、非编码RNA、重复序列、前噬菌体、基因岛、CRISPR等基因组成分的预测；
④ 功能注释 针对编码基因序列进行不同数据库的功能注释，包括常用的KEGG、COG数据库、针对病原微生物的数据库；
⑤ 基因组比较分析 此步骤从基因组、基因两层面分别比较样品与参考基因组的差异，包括共线性分析、基因家族构建、共有/特有基因分析、物种进化树构建。
（二）一代测定服务：400反应。
1．样本为PCR产物和引物，PCR产物未纯化，引物浓度为20μM。
2．★一代测定服务包括：序列测定在技术服务公司实验室完成，对PCR产物纯化，并按照送样者要求的长度进行基因序列测定。将测序结果以图谱形式反馈。
3．★ PCR产物纯化方式：胶回收纯化。
4．测序要求：双向或者单向，送检单会标明。
5．测序序列质量：一个正常的成功反应，能保证测序色谱图文件（*.abi） 峰形清晰，无杂峰，峰值明显。
6．★提供的结果为：测序色谱图文件（*.abi）、终序列、拼接序列（*.fas或*.fasta）。结果反馈地点及数量：按照采购方要求发往指定服务地点。
7．检测中使用的试剂和耗材均需为优质无菌。
8．开展服务的实验室符合二级生物安全实验室要求，具备生物安全柜。
9．凡该样本在检测过程中发生的污染和各类纠纷，后果由服务商承担。
10．★服务商负责样品运输，样本运输必须在带冰条件下运输。运输过程中造成的损失、污染、及各类纠纷，后果均由服务商承担。运输费用由服务商承担。
11．样本交接：根据采购方的要求，在广西壮族自治区疾病预防控制中心不定期进行标本交接。
12．服务商及技术服务公司未经采购方同意，不能将剩余样本另作他用或转让给第三方使用，根据采购方要求进行保存返回或按照相关规定处理。
（三）提供的成果
包含但不限于：出具检测原始数据、汇总结果（Excel文件列出标本名称以及对应的各指标结果）、样本接收单。
（四）提交服务成果时间
收到样本并质检合格后，一代测定服务于3～8个工作日内完成检测并返回结果；菌株全基因组测序于30个工作日内完成所有项目分析内容。售后服务包括能提供现场报告解读。若样本未检出或峰图有杂峰等无法分析，重测也如此，视为此次测序无效，采购方将不支付相应费用。如连续三次未及时反馈结果，采购方有权拒绝支付相应费用，并追究样本损失。
（五）其他要求：
1．开展服务的实验室符合二级生物安全实验室要求，具备生物安全柜。
2．凡该样本在检测过程中发生的污染和各类纠纷，后果由服务商承担。
3．★ 服务商负责样品运输，样本运输必须在带冰条件下运输。运输过程中造成的损失、污染、及各类纠纷，后果均由服务商承担。运输费用由服务商承担。
4．样本交接：根据采购方的要求，在广西壮族自治区疾病预防控制中心不定期进行标本交接。
5．服务商及技术服务公司未经采购方同意，不能将剩余样本另作他用或转让给第三方使用，根据采购方要求进行保存返回或按照相关规定处理。
① PCR产物测序使用的试剂应具备中华人民共和国医疗器械注册证（体外诊断试剂）或者为成熟的商业化试剂盒，使用的测序仪应具备中华人民共和国医疗器械注册证或者为成熟的商业化测序平台。
② 实验过程必须严格按照试剂说明书进行操作；在PCR产物质量过关的前提下，中标供应商须对每批样本测序实验进行质控，不可出现实验交叉污染、样本弄混等严重错误；出现此类错误导致的一切成本损耗皆由其负责。
③ 参与投标的供应商须具备纯化PCR产物的能力，并保证PCR产物符合测序要求；接收到待检样本后至建库测序数据产出，应有严格的质控标准；具有短期处理大量样本，进行一代测序的经验；不得将测序服务转包第三方公司。
④ 样本收取及运输管理：按照《可感染人类的高致病性病原微生物菌（毒）种或样本运输管理规定》的运输管理规范进行标本运输，根据采购人指定的时间、地点，由中标供应商上门收样后将样本运回实验室。
⑤ 采购人对检测调查结果拥有所有权，供应商对检测调查结果负有保密义务，仅提供给采购人或采购人指定的人员；未经采购人许可，不得对第三方泄露检测信息，不得在报刊杂志上发表或作其他任何用途的引用。
⑥ 中标供应商应在样本接收后及时对PCR产物进行质检，将结果反馈给采购人；所有未使用完的样本应免费保存至少1个月，并在必要时返回原样。剩余样本未经采购人同意不能将另作他用、转让给第三方使用或应按照相关规定高压后处理。
（六）服务地点：检测服务在中标供应商的实验室内完成。
（七）采购预算：3.14万元，其中菌株全基因组测序为700元/株、一代测定为26元/反应。
（八）报价要求：包括：服务的价格；必要的保险费用和各项税金；运输、装卸、安装、调试、培训、技术支持、售后服务、税金及其它所有成本费用的总和。
采购项目的名称、数量、简要规格描述详见附件报价表，须用使用统一格式报价表，否则投标无效。
（九）付款条件：按中标实际单价、实际检测并验收合格的份数进行结算。
（十）采购结果认定：满足采购需求的前提下最低价中标，超出预算的投标视为无效。
二、资格要求及条件
1.投标人须是国内注册企事业单位，拥有独立法人资格，具有有效的营业执照、税务登记证、组织机构代码、技术服务许可证、医疗机构执业许可证》、生物安全II级实验室备案证明。
2.检测实验室必须已开展测序服务实验（提供复印件，原件备查）并承诺独立完成本项目，不得转让或转包或分包。
3.投标人须符合《政府采购法》第二十二条规定的条件；
4.投标人在“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）或中国政府采购网（www.ccgp.gov.cn）查询相关供应商主体信用记录，将查询结果加盖投标人单位公章提交（必须提供，如为事业单位及高校可不提供）；
5.服务工作周期：签订合同之日起到2025年5月31日。如连续三次未及时反馈结果，采购方有权拒绝支付相应费用。
6.具有履行合同所必需的人员和专业服务能力；
7.国家法律、法规规定的其他要求；
8.验收方式：
供应商提供的成果包含提供的成果包含出具检测原始数据、汇总结果（Excel文件列出标本名称以及对应的各指标结果）、样本接收单等进行验收。
9.付款方式
按实际检测份数及项目报价单价结算，采购人收到并对结果无异议，凭验收单中的检测实际数量，根据供应商开具相应发票，在10个工作日内支付全部的费用。采购人对发票有异议的，应在收到发票后3日内向供应商提出异议，双方协商解决。
10.其他：应统一按附件报价表进行报价，不能恶意低价投标。
11.投标人根据报价表填写拟采购项目相关信息及价格一同密封提交（资格要求及条件材料装订成册）。闭封袋密封处需加盖递交单位公章，密封文件袋封面须注明产品名称，递交公司全称（信封密封口盖骑缝章）。
三、投送材料截止时间、地点
1.截止日期：2024年5月31日下午16点；
2.截止地点：南宁市青秀区金洲路18号广西疾病预防控制中心行政楼2楼206号房。采购管理科联系人及电话：蒙婧婷、李杰文0771-2521500。
fw-003统一报价表.xlsx
广西壮族自治区疾病预防控制中心
2024年5月23日
微信扫码关注
